内源代谢物亲和探针:生物素-哌啶酸Biotin-Pipecolic acid|Biotin-Pip赖氨酸代谢物 Pull-down 核心工具
一、探针基础介绍生物素 - 哌啶酸Biotin-Pipecolic acid亲和探针依托生物素 - 链霉亲和素富集体系结合 Pull-downLC-MS 蛋白质组学直接捕获哌啶酸结合蛋白是植物免疫、神经代谢、微生物互作领域关键化学工具。探针模块化结构哌啶酸杂环母核 Linker烷基 / PEG4 生物素二、合成方法哌啶酸两性离子结构是识别靶蛋白的基础羧基、环仲胺任意位点被封闭极易大幅降低结合活性。核心原则优先选择正交保护策略挑选空间位阻较小的衍生位点单点修饰最大限度保留羧基与环仲胺环仲胺选择性烷基化衍生【Pull-down 首选路线】合成路线1.温和条件下保护 α 位羧基避免羧基被偶联封闭2.环上仲胺与带有游离伯氨基的烷基卤化物发生选择性烷基化接入 Linker3.脱保护释放游离羧基末端伯氨基与 Biotin-LC-NHS / Biotin-PEG4-NHS 酰胺偶联4.制备型反相 HPLC 纯化去除游离生物素、双取代杂质冻干获得纯品探针。优势完整保留羧基维持分子两性离子特征酰胺键生理缓冲液稳定不易水解。Linker 推荐优先选用PEG4 柔性接头降低空间位阻减弱静电非特异性吸附。三、科研应用方向哌啶酸结合蛋白 pull-down LC-MS/MSPDE 机制与 ALDH7A1 互作植物免疫信号研究亲和固定与代谢物筛选同系列探针生物素-左旋多巴生物素-胆固醇琥珀酸单酯生物素-胆固醇生物素-烟酰胺生物素-3β-羟基-5-胆稀酸生物素-全氟辛酸生物素-γ-氨基丁酸,Biotin-GABABiotin-Gambogenic acid生物素-甘油磷酸钠盐Biotin-Putrescine生物素-昆布多糖Biotin-ALCARBiotin-HydrazideBiotin-AbacavirBiotin-CD环糊精生物素-人参皂苷Rg1生物素-木瓜蛋白酶生物素-乳酸氧化酶生物素-牛胰岛素生物素-大豆分离蛋白生物素-C-反应蛋白生物素-乳清蛋白生物素-角蛋白生物素-肌红蛋白生物素-牛血红蛋白生物素-牛纤维蛋白原生物素-硫辛酸