1、AutoDock简介AutoDock 是全球公认分子对接、药物虚拟筛选标准开源软件专门用于小分子配体与蛋白靶点相互作用模拟计算是计算机辅助药物设计、药理学、分子生物学科研必备核心工具。2、核心工作原理采用半柔性对接算法固定蛋白骨架允许氨基酸侧链柔性摆动小分子自由旋转、平移、构象变化。 通过热力学自由能打分模拟分子天然结合姿态精准预测结合模式、结合亲和力、靶点结合位点。3、主要专业功能预测蛋白 - 小分子结合自由能、抑制常数 Ki分析氢键、疏水作用、π-π 堆积、盐桥等分子相互作用批量化合物虚拟筛选快速筛选潜在活性先导化合物蛋白突变耐药机制、结合位点口袋分析天然产物、中药小分子靶点预测与结合模式验证对接构象聚类、最优结合姿态筛选与可视化分析4、配套体系AutoDock核心对接运算程序AutoDockToolsADT蛋白配体预处理、盒子设置、结果可视化AutoDock Vina新一代高速高精度对接引擎运算更快、准确度更高安装包https://pan.quark.cn/s/d208426bf8d71.解压安装包2.双击先安装Python2.7.11(注意2.7版本好兼容本软件)3.勾选【Install for all Users】点击【Next】。4.这里可以更改安装位置把字母C改为其盘符即可点击【Next】。5.点击【Next】。6.点击【Finish】。7.【win10】点击电脑关于然后点击高级系统设置。【win11】可以右键点击此电脑或计算机选择属性点击高级系统设置8.选择【高级】点击【环境变量】9.系统环境变量选择【Path】点击【编辑】。10.点击【新建】添加2个环境变量【D:\Python27】、【D:\Python27\Scripts】点击【确定】。后面都是一路确定直到关闭所有页面。(注意这里的环境变量就是“第4步”你设置的位置填你改变的Python位置即可)11.按住“winR”输入cmd点击【确定】12.命令行输入 python --version显示python版本即可。13.进入解压后的【Autodock】文件夹双击【autodocksuite-4.2.6】运行安装14.修改安装路径在你安装的地方新建一个Autodock文件夹记住路径后面要用到。15.安装完成点击【Close】。16.进入解压后的【Autodock】文件夹双击【mgltools_win32_1.5.7】安装17.点击【Next】。18.勾选【I accept...】点击【Yes】。19.这里不要修改安装路径直接点击【Next】。20.等待安装21.点击【ok】。22.取消勾选【LaunchPMV】点击【Finish】。23.在D盘新建一个【Autodock-setting】文件夹。(你自己想要安装的地方都可以)24.把第14步安装的Autodock下的【autodock4.exe】和【autogrid4.exe】两个文件复制到【Autodock-setting】文件夹下来。25.把第19步安装的MGLTools-1.5.7下的【adt.bat】文件复制到【Autodock-setting】文件夹下来。26.双击桌面【AutoDockTools-1.5.7】图标。27.点击【File】选择【Preferences】选择【Set】。28.将D盘(或者你安装的地方)新建的【Autodock-setting】文件夹的路径复制到startup directory点击【make default】。29.再次打开软件安装完成