05.Ubuntu环境下编译安装Schrodinger Suite
一、项目介绍schrodinger官网https://www.schrodinger.com/下载地址https://install.schrodinger.com/software/releases/installers/25-3_build-131/Schrodinger_Suites_2025-3_Linux-x86_64.tar?Expires1755050803KeyNameprod-corp-website-private-releases-bucket-signing-keySignature1-xUCTCM5zwTSvAdI-cQxGGmepo Schrödinger提供致力于解决药物研究中挑战的完整软件套装。对于以结构为基础的药物设计Prime是一款精确蛋白质结构预测软件包Glide执行准确迅速的配体-受体对接Liaison预测结合与亲和力QSite用来研究蛋白质活性区域内的反应机制Schrödinger还提供Phase用于作基于配体的药效建模QikProp用于候选药物的ADME性状预测。另外LigPrep是一款用于深度计算机分析配体库准备的快速2D至3D转换程序。最近Schrödinger还引入CombiGlide用于焦点库设计引入Epik对生物环境中的配体质子化状态做精确枚举。 此外Schrödinger还提供利用计算化学最新技术的产品。Jaguar高性能初始量子力学组件MacroModel分子模拟领域最受信赖的名字已经广泛地应用于从材料到生命科学等全面的化学研究中。Strike是一款用于检查组织性能关系的化学方法统计程序包。 Maestro是所有Schrödinger计算机程序的用户接口提供提供强大、充分集成的分子的显现和分析环境。薛定谔是计算化学领域的科学领袖为生命科学和材料研究提供软件解决方案和服务。薛定谔旨在提供真正满足客户需求的集成软件解决方案和服务。我们希望通过先进的计算技术改变化学家设计化合物和材料的方式使世界各地的研究人员能够实现改善人类健康和生活质量的目标。通过构建和部署突破性的科学软件解决方案形成合作和伙伴关系我们帮助科学家加快研发活动降低成本并做出可能不可能的新发现。薛定谔软件套件是一个同时使用基于配体和结构的方法的药物设计软件。薛定谔提供了准确、可靠和高性能的计算技术来解决生命科学研究中的现实问题。它为新型候选药物的设计、选择和优化提供了卓越的解决方案和服务。薛定谔的预测模型将使药物发现科学家能够在发现过程的早期评估化合物的性质并选择具有最佳特征的候选药物。薛定谔软件的预测能力使科学家能够加快他们的研发活动降低研究成本并做出其他计算或实验方法可能无法实现的新发现。二、编译安装schrodinger的软件有个硬性条件需要开启独显检查方式glxinfo | grep OpenGL version命令输出结果里有compatibility profile的就是没打开没有这个才正常。Ubuntu on Xorg模式通过nvidia-xconfig生成/etc/X11/xorg.conf文件生成的文件中nvidia设备中没有BusID需要通过lspci | grep -i nvidia查看设备busid参考这篇资料的Ubuntu中NVIDIA驱动CUDAcuDNN安装配置黑屏处理部分。安装sudo apt install prime-select命令通过prime-select nvidia设置为nvidia独显。环境准备好之后就开始正式编译chmodx INSTALLsudo./INSTALL在那个extract to dir那个压缩文件里libmmfileshared那个文件没有替换成功再复制一次到根目录的internal/bin里: