2026全新版本单细胞云平台SeekSoul Online从2024年的1.5天学会单细胞分析到2025年的听说你想两天学会单细胞分析这一路走来感谢每一位同学的陪伴与认可单细胞云平台课程视频在B站的播放量已经达到了1.8w收到了大量的好评感谢大家的支持。另外这三年间SeekSoul Online单细胞云平台的功能在不断的迭代和更新。今天我们带着2026全新版本的内容回归啦~花费短短四天内学会scRNA-seq代码从小白到大神是不太可能的我们的代码教程一直持续了两个月咧。不过忽略编程的学习成本(听到最多的吐槽就是我要上门诊/做实验哪有时间学编程)在拥有单细胞背景知识的情况下花四天时间掌握云平台后还是能够获得很多单细胞分析能力的。所以这次就带大家一起学习《Nature Nanotechnol》都在用的零代码云平台全新课表如下报名费用免费免费免费课程时间10月13日、15日、20日、22日你需要准备一台能打开浏览器、能上网的电脑参与方式线上线下同步开展联系客服微信获取生信基地线下地址~直播预约课程资料下载https://pan.baidu.com/s/1W0WRNaqQGZcL6lykds0nEg?pwd2keeSeekSoul Online课程主要内容一、云平台介绍与scRNA分析1.1 云平台简介1.2 scRNA基础分析多样本整合、聚类分群、细胞注释1.3 画图工具、亚群分析、特征分析、差异富集分析1.4 高级分析拟时序分析、转录因子分析、细胞通讯分析、肿瘤异质性分析、基因集合分析、单细胞代谢分析、单细胞扰动分析、交互分析二、单细胞全长转录组scFast2.1 绪论2.2 项目建立和基础分析2.3 高级分析lncRNA-mRNA共表达分析、Fusion融合基因分析、mut突变分析、rMATS可变剪切分析三、一胞双组ATACscRNA3.1 绪论3.2 项目建立和基础分析3.3 高级分析基因活力分析、差异peak分析、Peak2Gene分析、TF-Peak-Gene三元组分析、SCENIC调控网络分析、ATAC_Monocle3拟时序分析、ATAC拷贝数变异分析、ATAC交互分析四、一胞双组空转scRNA4.1 绪论4.2 项目建立和基础分析4.3 高级分析生态位分析、空间细胞通讯分析、空间共定位分析、空间交互分析更多scRNAVDJ、scRNA16s、scRNA_ont、AI…持续更新中敬请期待~欢迎入群潜水课后作业作业1文章标题Single cell analysis in head and neck cancer reveals potential immune evasion mechanisms during early metastasis文章中文标题对头颈部癌症的单细胞分析揭示了早期转移过程中潜在的免疫逃逸机制。文章链接https://www.nature.com/articles/s41467-023-37379-y发表期刊Nature Communications样本名称(1)如下图的文章展示 进行大群注释、组间umap图、各细胞类型marker基因小提琴图展示、细胞类型占比分布(2)对肿瘤细胞就是上皮细胞拷贝数变异已确定完成细胞亚群分析图a对个样本上皮细胞EMT基因集打分图b对HN251、HN279样本的肿瘤细胞进行组间拟时序分析图c、d作业2文章标题Temporal Analyses of Postnatal Liver Development and Maturation by Single Cell Transcriptomics文章中文标题单细胞转录组学对出生后肝脏发育和成熟的时间分析文章链接https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8842999/发表期刊Developmental Cell① 如下图的展示 进行大群聚类注释图A、各细胞类型marker基因气泡图图b按照样本分组展示umap降维图图c展示组间的tsne图图d、以小提琴图展示各样本三个基因表达代替山脊图②对肝细胞进行亚群分析展示各样本的umap降维图、和scd2基因的featureplot图③对不同发育的肝细胞进行拟时序分析得到如下图类似结果