空间转录组测量的是mRNA空间表达。它的优势在于无偏性地发现所有基因的表达模式但mRNA水平并不完全等同于有功能的蛋白质的丰度和定位会受转录后调控影响。PCFCODEX空间单细胞蛋白组检测的是预先选定的特定蛋白质可以在组织切片上同时成像数十种蛋白质并精确分析它们的共定位关系可以一次性解析多种细胞类型的复杂空间互作。它直接在最接近功能的蛋白质层面进行验证提供了更直接的生物学功能证据。PCFCODEX图像基于荧光显微镜能提供非常清晰的细胞和组织形态学背景。对于母胎界面这样同时包含胎儿来源滋养层细胞、母体蜕膜细胞、血管细胞和免疫细胞的组织单一技术往往只能看到其中一部分答案。PCF80以80抗体Panel为基础适合在空间转录组发现候选区域或候选细胞状态后继续补充蛋白功能证据让“PCF80看透组织中的每个细胞”在多组学研究流程中具有清晰定位。近日《Nature》期刊发表了一项题为“Single-cell spatiotemporal dissection of thehuman maternal–fetal interface”的母胎界面研究正体现了这种技术互补。研究使用Stereo-seq对中期妊娠胎盘基底板样本进行空间全转录组测序重建大规模空间转录组图谱并开展空间共现、细胞群落、细胞间通讯和拟时序分析。随后使用PCFCODEX空间单细胞蛋白组进行直接原位分析尤其用于理解EVT重塑螺旋动脉过程中动脉内皮细胞的连续状态。研究中提到的caEC、R0、R1和R2状态不仅涉及分子表达差异也涉及细胞与血管壁之间的空间距离变化。在实际课题中从空间转录组升级到PCF80并不是简单重复验证而是把“转录线索”转化为“蛋白证据”。空间转录组能够无偏发现表达区域和候选通路但mRNA水平受到转录后调控影响不一定等同于蛋白丰度和定位。PCF80检测预先设计的蛋白标志物可在同一组织切片上观察多类细胞类型、功能状态和组织结构。研究者可以先根据空间转录组筛选关键细胞群、差异区域和相互作用线索再用PCF80验证蛋白表达、细胞共定位和邻域关系。这种组合特别适合三类母胎界面课题。第一类是发育轨迹与谱系分化例如VCT向EVT或SCT分化后的空间定位和蛋白状态验证第二类是组织结构重塑例如EVT侵袭、螺旋动脉改建、内皮细胞脱离和血管微环境变化第三类是疾病相关机制例如子痫前期、早产或流产相关风险细胞在母体侧或胎儿侧的空间分布。对于准备发表高质量研究的团队多组学之间的闭环验证往往比单一技术结果更具解释力。因此PCF80与空间转录组不是替代关系而是互补关系。空间转录组帮助发现问题PCF80帮助在蛋白和组织结构层面核对问题。对于母胎界面研究而言这种对比升级的核心不是“更多数据”而是“更完整证据链”从mRNA表达到蛋白表达从细胞注释到原位定位从组织区域到细胞邻域。PCF80作为空间蛋白组方案可以帮助研究者把候选机制放回真实组织环境中检验为母胎界面复杂生物学问题提供更稳健的研究路径。【说明】本文仅为科研技术方法介绍不涉及疾病诊断、治疗建议或用药指导。文中提及的研究发现均来自学术文献不构成任何医疗意见。如有健康问题请咨询专业医疗机构。参考文献Wang, C., Zhou, Y., Wang, Y. et al. Single-cell spatiotemporal dissection of the human maternal–fetal interface. Nature (2026). DOI: 10.1038/s41586-026-10316-x。