PCF80空间单细胞蛋白组在CAF异质性研究中的应用
在肿瘤微环境研究中癌症相关成纤维细胞CAF正在从“背景基质细胞”变成影响肿瘤进展、免疫反应和治疗响应的重要研究对象。PCF80是基于80抗体Panel的空间单细胞蛋白组旗舰版可在组织原位同时观察细胞身份、功能状态、空间位置、邻近关系和组织微环境全景。近期《Nature Cancer》在线发表了题为 “Heterogeneity and plasticity of cancer-associated fibroblasts” 的重磅综述文章系统梳理了CAF的异质性与可塑性。文献指出传统Bulk组学会把CAF、肿瘤细胞、免疫细胞等多种来源的信号混在一起难以说明信号来自哪类细胞单细胞测序虽然能够拆解细胞群体却常常丢失组织结构和原位空间关系。对于CAF而言这一局限尤其明显因为CAF的功能并不只由自身表达谱决定还高度依赖其所在生态位。文献总结了肿瘤细胞相邻生态位、肿瘤外周/血管周生态位、TLS生态位和神经周围生态位等典型空间场景提示CAF研究需要把“亚型”和“位置”放在一起理解。PCF80可以从蛋白层面切入这一类问题。通过80抗体Panel设计研究者可将CAF相关标志物、ECM组分、肿瘤细胞标志物、T细胞/B细胞/髓系细胞标志物以及功能状态指标整合到同一张组织切片上获得单细胞级别的空间蛋白图谱。与只看少数免疫荧光指标相比PCF80更适合在复杂微环境中同时识别myCAF、iCAF、apCAF等候选表型并结合其与肿瘤边缘、血管周围、TLS区域或神经周围结构的相对位置形成更完整的CAF生态位描述。这类方案适合多种CAF相关课题。例如肿瘤侵袭前沿的myCAF富集及ECM重塑研究血管周围iCAF与髓系细胞、内皮细胞的空间邻近研究TLS区域apCAF与CD4 T细胞、B细胞空间共定位研究胰腺癌、结直肠癌等实体瘤中的神经周围CAF生态位研究以及免疫治疗、化疗、靶向治疗或放疗后CAF状态改变的组织原位验证研究。对于已有单细胞测序结果的团队PCF80也适合作为蛋白层面和空间层面的补充验证把转录亚群落回到组织结构之中。总体来看CAF异质性研究正在从“发现一个marker”走向“解析一个生态位”。PCF80的价值在于把80抗体Panel、多细胞类型识别、功能状态判断和空间邻域分析结合起来帮助研究者在同一组织环境中观察CAF与肿瘤细胞、免疫细胞、血管、ECM之间的关系。它不能替代机制实验也不直接给出临床结论但可以为CAF亚群分型、空间定位和微环境互作研究提供更系统的原位蛋白证据。对于希望深入理解肿瘤基质微环境的科研团队而言PCF80是一种值得纳入研究设计的空间蛋白组工具。文献参考Pramod S, Lavon H, Scherz-Shouval R, Sherman MH. Heterogeneity and plasticity of cancer-associated fibroblasts. Nat Cancer. 2026. https://doi.org/10.1038/s43018-026-01146-x